研究报告

菊芋果聚糖合成酶基因 1-FFT 启动子克隆与功能分析  

孙雪梅 1,3,4,5 , 宗渊 1,2,5 , 杨世鹏 4,5 , 王丽慧 4,5 , 张怀刚 1,2,3*
1 中国科学院西北高原生物研究所, 西宁, 810000; 2 中国科学院西北高原生物研究所, 青海省作物分子育种重点实验室, 西宁, 810000; 3 中国科学院大学, 北京, 100049; 4 青海省农林科学院, 青海省蔬菜遗传与生理重点实验室, 西宁, 810000; 5 青海大学农牧学院, 西宁, 810000
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 9 篇   
收稿日期: 2019年01月20日    接受日期: 2019年01月28日    发表日期: 2020年05月20日
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摘要

本研究通过 Tail-PCR 方法分离到菊芋 1-FFT 基因上游长度为 1 611 bp 的片段(FFTP)。神经网络启动子在 FFTP 序列中预测到 8 个启动子核心结构,瞬时表达结果显示起始密码子上游 400 bp 的启动子核心结构域与 1 611 bp 的启动 GUS 基因表达的活性无明显差异,表明 -296 到 -246 区域就是 1-FFT 基因的启动子区域。PlantCARE 分析表明,FFTP 序列中除基本启动子元件(TATA-box CAAT-box)外,还含有与 MYB 转录因子结合的元件 3 个,参与光调控的顺式作用元件 12 个,茉莉酸反应、厌氧过程、脱落酸、抗逆反应的元件各 2 个,昼夜节律控制、生长素和赤霉素反应的元件各 1 个。这些顺式作用元件的鉴定为 1-FFT 参与相应的生物学过程提供理论依据。
 

关键词
菊芋(Helianthus tuberosus L.);果聚糖;1-FFT;启动子;功能分析

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《分子植物育种》印刷版
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